{ "description": null, "_filename": "StructureDefinition-Biobank.json", "package_name": "de.medizininformatikinitiative.kerndatensatz.biobank", "date": null, "derivation": "specialization", "publisher": null, "fhirVersion": "4.0.1", "name": "Biobank", "abstract": false, "type": "https://www.medizininformatik-initiative.de/fhir/ext/modul-biobank/StructureDefinition/LogicalModel/Biobank", "experimental": null, "resourceType": "StructureDefinition", "title": null, "package_version": "0.9.0", "status": "draft", "id": "6c453e46-91af-42b5-8362-c78387b7f930", "kind": "logical", "url": "https://www.medizininformatik-initiative.de/fhir/ext/modul-biobank/StructureDefinition/LogicalModel/Biobank", "version": null, "differential": { "element": [ { "path": "Biobank" }, { "path": "Biobank.Bioprobe", "type": [ { "code": "BackboneElement" } ], "definition": "Bioprobe" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Proben-ID", "type": [ { "code": "Identifier" } ], "definition": "Einrichtungsinterner Identifier der Probe" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Probenart", "type": [ { "code": "CodeableConcept" } ], "definition": "Art der Probe; SCT vepflichtend; Beschraenkung auf Specimen ValueSet erwuenscht." }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Probenmenge", "type": [ { "code": "Quantity" } ], "definition": "Probenmenge" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Verfügbarkeitsstatus", "type": [ { "code": "Code" } ], "definition": "Status der Probe / des Materials hinsichtlich der Verfügbarkeit" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Projektverwendung", "type": [ { "code": "String" } ], "definition": "Freitextangabe zur Verwendung der Probe in Projekten" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Sonstige Eigenschaften", "type": [ { "code": "String" } ], "definition": "Freitextangabe weiterer Probeneigenschaften" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Ist gewonnen aus", "type": [ { "code": "Reference" } ], "definition": "Referenz auf Bioprobe" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Diagnose", "type": [ { "code": "Reference" } ], "definition": "Informationen zu einer mit der Probe in Zusammenhang stehende Diagnose. Hier soll auf eine Diagnose gemäß der Vorgaben des KDS Modules Diagnose verlinkt werden wobei insbesondere bei neu erstellten Diagnosen -die nicht bereits aus anderen Quellen vorliegen- auf die Angabe einer Quelle zu achten ist; z.B. Informationen aus einem nur in unstrukturierter Form vorliegendem Pathologiebefund." }, { "path": "Biobank.Bioprobe.gehoert zu", "type": [ { "code": "Reference" } ], "definition": "Zuordnung der Probe zu einer Sammlung/Biobank" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Primaercontainer", "type": [ { "code": "BackboneElement" } ], "definition": "Probenbehältnis" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Primaercontainer.Containertyp", "type": [ { "code": "CodeableConcept" } ], "definition": "Typ des Containers." }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Primaercontainer.Kapazitaet", "type": [ { "code": "Quantity" } ], "definition": "Kapazitaet des Probencontainers" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Primaercontainer.Verwendung Additiv", "type": [ { "code": "boolean" } ], "definition": "Ja/Nein Angabe ob ein Zusatzstoff verwendet wurde" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Primaercontainer.Additiv", "type": [ { "code": "CodeableConcept" } ], "definition": "Zusatzstoffe im Container" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Probenentnahme", "type": [ { "code": "BackboneElement" } ], "definition": "Informationen zur Entnahme der Probe" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Probenentnahme.Entnahme-ID", "type": [ { "code": "Identifier" } ], "definition": "Entnahme-ID" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Probenentnahme.Einstellung Blutversorgung", "type": [ { "code": "dateTime" } ], "definition": "Zeitpunkt der Einstellung der Blutversorgung zur Probe. Kann zur Berechnung der warmen Ischaemiezeit verwendet werden." }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Probenentnahme.Entnahmezeitpunkt", "type": [ { "code": "dateTime" } ], "definition": "Zeitpunkt der Ent- / Abnahme der Probe. Kann zur Berechnung der kalten Ischaemiezeit verwendet werden." }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Probenentnahme.Entnahmestelle", "type": [ { "code": "CodeableConcept" } ], "definition": "Lokalisation der Koerperstelle von der die Probe stammt" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Probenentnahme.Nuechternstatus", "type": [ { "code": "CodeableConcept" } ], "definition": "Nüchterstatus des/der Patent:in zum Zeitpunkt der Entnahme der Probe. Muss aus dem http://terminology.hl7.org/ValueSet/v2-0916 stammen." }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Probenentnahme.Nuechternstatus Dauer", "type": [ { "code": "Quantity" } ], "definition": "Zeitliche Dauer der Nüchternheit vor der Probenentnahme" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess", "type": [ { "code": "BackboneElement" } ], "definition": "Prozedur der Probenbearbeitung" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess.Startzeitpunkt", "type": [ { "code": "dateTime" } ], "definition": "Zeitpunkt des Beginns der Probenbearbeitung" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess.Endzeitpunkt", "type": [ { "code": "dateTime" } ], "definition": "Zeitpunkt des Abschlusses der Probenbearbeitung" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess.Verarbeitungstyp", "type": [ { "code": "BackboneElement" } ], "definition": "Prozedur der Probenbearbeitung" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess.Temperatur", "type": [ { "code": "Range" } ], "definition": "Temperatur bei der die Probenverarbeitung stattfand. Angabe exakt oder in Wertebereichen siehe SPREC+" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess.Modus", "type": [ { "code": "CodeableConcept" } ], "definition": "Abhängig vom Verarbeitungstyp - bei Zentrifugation SPREC" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess.Verwendung Additive", "type": [ { "code": "boolean" } ], "definition": "Ja/Nein Angabe ob ein Zusatzstoff verwendet wurde" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess.Additiv", "type": [ { "code": "CodeableConcept" } ], "definition": "Additive bei der Probenbearbeitung wie Fixationsmittel; Einbettungs- und Eindeckungsmedien" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Lagerprozess", "type": [ { "code": "BackboneElement" } ], "definition": "Lagerung einer Probe" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Lagerprozess.Einfrierzeitpunkt", "type": [ { "code": "dateTime" } ], "definition": "Zeitpunkt des Beginns der Einlagerung der Probe" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Lagerprozess.Auftauzeitpunkt", "type": [ { "code": "dateTime" } ], "definition": "Zeitpunkt des Endes der Einlagerung der Probe" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Lagerprozess.Lagerungsbedingungen", "type": [ { "code": "Range" } ], "definition": "Temperaturbereich in dem die Probe gelagert wurde bzw. wird. Angabe in Wertebereichen wie in SPREC" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Laborbefund", "type": [ { "code": "Reference" } ], "definition": "Referenz auf den zu einer Probe gehörenden Laborbefund" }, { "path": "Biobank.Bioprobe.Pathologiebefund", "type": [ { "code": "Reference" } ], "definition": "Referenz auf den zu einer Probe gehörenden Pathologiebefund" }, { "path": "Biobank.Probensammlung - Biobank", "type": [ { "code": "BackboneElement" } ], "definition": "Organisation die Proben verwaltet" }, { "path": "Biobank.Probensammlung - Biobank.Kontakt", "type": [ { "code": "BackboneElement" } ], "definition": "Kontaktinformationen einer Sammlung/Biobank für Anfragen zu Bioproben" }, { "path": "Biobank.Probensammlung - Biobank.Kontakt.Vorname", "type": [ { "code": "String" } ], "definition": "Vorname der Ansprechperson" }, { "path": "Biobank.Probensammlung - Biobank.Kontakt.Nachname", "type": [ { "code": "String" } ], "definition": "Nachname der Ansprechperson" }, { "path": "Biobank.Probensammlung - Biobank.Kontakt.E-Mail", "type": [ { "code": "String" } ], "definition": "E-Mailadresse für Anfragen" }, { "path": "Biobank.Probensammlung - Biobank.Kontakt.Rolle", "type": [ { "code": "CodeableConcept" } ], "definition": "Rolle der Ansprechperson in der Sammlung/Biobank" }, { "path": "Biobank.Probensammlung - Biobank.Kontakt.Adresse", "type": [ { "code": "Address" } ], "definition": "Kontaktadresse für Forschungsvorhaben" }, { "path": "Biobank.Probensammlung - Biobank.Sammlungs-ID", "type": [ { "code": "Identifier" } ], "definition": "Interner Identifer der Sammlung/Biobank" }, { "path": "Biobank.Probensammlung - Biobank.BBMRI-ERIC-ID", "type": [ { "code": "Identifier" } ], "definition": "Identifier der Sammlung/Biobank im BBMRI ERIC Netzwerk" }, { "path": "Biobank.Probensammlung - Biobank.Akronym", "type": [ { "code": "String" } ], "definition": "Akronym der Sammlung/Biobank" }, { "path": "Biobank.Probensammlung - Biobank.Name", "type": [ { "code": "String" } ], "definition": "Name der Sammlung/Biobank" }, { "path": "Biobank.Probensammlung - Biobank.Beschreibung", "type": [ { "code": "String" } ], "definition": "Beschreibung der Sammlung/Biobank" }, { "path": "Biobank.Probensammlung - Biobank.Sammlungstyp", "type": [ { "code": "CodeableConcept" } ], "definition": "Typ der Sammlung/Biobank gemäß BBMRI ERIC Directory Werteliste" }, { "path": "Biobank.Probensammlung - Biobank.besteht aus", "type": [ { "code": "Reference" } ], "definition": "Verknüpfung der Teilsammlungen" } ] }, "baseDefinition": "http://hl7.org/fhir/StructureDefinition/Element" }