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"description": "Logische Repräsentation des Erweiterungsmoduls Biobank",
"_filename": "StructureDefinition-Biobank.json",
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"type": "https://www.medizininformatik-initiative.de/fhir/ext/modul-biobank/StructureDefinition/LogicalModel/Biobank",
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"resourceType": "StructureDefinition",
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} ],
"short": "Details zu einer Bioprobe",
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"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Details zu einer Bioprobe"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Proben-ID",
"max": "1",
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"type": [ {
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} ],
"short": "Einrichtungsinterner Identifier der Probe",
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"map": "Specimen.identifier",
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"definition": "Einrichtungsinterner Identifier der Probe"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Probenart",
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"short": "Art der Probe; SCT verpflichtend; Beschränkung auf Specimen ValueSet erwünscht.",
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"definition": "Art der Probe; SCT verpflichtend; Beschränkung auf Specimen ValueSet erwünscht."
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Probenmenge",
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} ],
"short": "Probenmenge",
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"definition": "Probenmenge"
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"id": "Biobank.Bioprobe.Verfuegbarkeitsstatus",
"max": "1",
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} ],
"short": "Status der Probe / des Materials hinsichtlich der Verfügbarkeit",
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"map": "Specimen.status",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Status der Probe / des Materials hinsichtlich der Verfügbarkeit"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Projektverwendung",
"max": "1",
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"path": "Biobank.Bioprobe.Projektverwendung",
"type": [ {
"code": "string"
} ],
"short": "Freitextangabe zur Verwendung der Probe in Projekten",
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"map": "Specimen.note",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Freitextangabe zur Verwendung der Probe in Projekten"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.SonstigeEigenschaften",
"max": "1",
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"type": [ {
"code": "string"
} ],
"short": "Freitextangabe weiterer Probeneigenschaften",
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"map": "Specimen.note",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Freitextangabe weiterer Probeneigenschaften"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Ist-gewonnen-aus",
"max": "1",
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"type": [ {
"code": "Reference"
} ],
"short": "Referenz auf Bioprobe",
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"map": "Specimen.parent",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Referenz auf Bioprobe"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.FestgestellteDiagnose",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Bioprobe.FestgestellteDiagnose",
"type": [ {
"code": "Reference"
} ],
"short": "Verweis auf eine Diagnose für die Material in der Probe enthalten ist",
"mapping": [ {
"map": "Specimen.extension[diagnose]",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Verweis auf eine Diagnose für die Material in der Probe enthalten ist"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.gehoert-zu",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Bioprobe.gehoert-zu",
"type": [ {
"code": "Reference"
} ],
"short": "Zuordnung der Probe zu einer Sammlung/Biobank",
"mapping": [ {
"map": "Specimen.extension[gehoertZu]",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Zuordnung der Probe zu einer Sammlung/Biobank"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Container",
"max": "1",
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"type": [ {
"code": "BackboneElement"
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"short": "Probenbehältnis",
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"map": "Specimen.container",
"identity": "FHIR"
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"definition": "Probenbehältnis"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Container.Containertyp",
"max": "1",
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"path": "Biobank.Bioprobe.Container.Containertyp",
"type": [ {
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} ],
"short": "Typ des Containers",
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"map": "Specimen.container.type",
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"definition": "Typ des Containers"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Container.Kapazitaet",
"max": "1",
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"type": [ {
"code": "Quantity"
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"short": "Kapazität des Probencontainers",
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"map": "Specimen.container.capacity",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Kapazität des Probencontainers"
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"id": "Biobank.Bioprobe.Container.VerwendungAdditiv",
"max": "1",
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"type": [ {
"code": "boolean"
} ],
"short": "Ja/Nein Angabe, ob ein Zusatzstoff verwendet wurde",
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"identity": "FHIR"
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"definition": "Ja/Nein Angabe, ob ein Zusatzstoff verwendet wurde"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Container.Additiv",
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"path": "Biobank.Bioprobe.Container.Additiv",
"type": [ {
"code": "CodeableConcept"
} ],
"short": "Zusatzstoffe im Container",
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"identity": "FHIR"
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"definition": "Zusatzstoffe im Container"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Probenentnahme",
"max": "1",
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"path": "Biobank.Bioprobe.Probenentnahme",
"type": [ {
"code": "BackboneElement"
} ],
"short": "Informationen zur Entnahme der Probe",
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"map": "Specimen.collection",
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} ],
"definition": "Informationen zur Entnahme der Probe"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Probenentnahme.Entnahme-ID",
"max": "1",
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"type": [ {
"code": "Identifier"
} ],
"short": "Entnahme-ID",
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"map": "Specimen.collection.request",
"identity": "FHIR"
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"definition": "Entnahme-ID"
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"id": "Biobank.Bioprobe.Probenentnahme.EinstellungBlutversorgung",
"max": "1",
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"path": "Biobank.Bioprobe.Probenentnahme.EinstellungBlutversorgung",
"type": [ {
"code": "dateTime"
} ],
"short": "Zeitpunkt der Einstellung der Blutversorgung zur Probe. Kann zur Berechnung der warmen Ischaemiezeit verwendet werden.",
"mapping": [ {
"map": "Specimen.collection.extension[einstellungBlutversorgung]",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Zeitpunkt der Einstellung der Blutversorgung zur Probe. Kann zur Berechnung der warmen Ischaemiezeit verwendet werden."
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Probenentnahme.Entnahmezeitpunkt",
"max": "1",
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"path": "Biobank.Bioprobe.Probenentnahme.Entnahmezeitpunkt",
"type": [ {
"code": "dateTime"
} ],
"short": "Zeitpunkt der Ent- / Abnahme der Probe. Kann zur Berechnung der kalten Ischaemiezeit verwendet werden.",
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"map": "Specimen.collection.collected[x]",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Zeitpunkt der Ent- / Abnahme der Probe. Kann zur Berechnung der kalten Ischaemiezeit verwendet werden."
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Probenentnahme.Entnahmestelle",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Bioprobe.Probenentnahme.Entnahmestelle",
"type": [ {
"code": "CodeableConcept"
} ],
"short": "Lokalisation der Körperstelle, von der die Probe stammt",
"mapping": [ {
"map": "Specimen.collection.bodySite",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Lokalisation der Körperstelle, von der die Probe stammt"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Probenentnahme.Nuechternstatus",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Bioprobe.Probenentnahme.Nuechternstatus",
"type": [ {
"code": "CodeableConcept"
} ],
"short": "Nüchterstatus des:der Patent:in zum Zeitpunkt der Entnahme der Probe. Muss aus dem http://terminology.hl7.org/ValueSet/v2-0916 stammen.",
"mapping": [ {
"map": "Specimen.collection.fastingStatusCodeableConcept",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Nüchterstatus des:der Patent:in zum Zeitpunkt der Entnahme der Probe. Muss aus dem http://terminology.hl7.org/ValueSet/v2-0916 stammen."
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Probenentnahme.NuechternstatusDauer",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Bioprobe.Probenentnahme.NuechternstatusDauer",
"type": [ {
"code": "Quantity"
} ],
"short": "Zeitliche Dauer der Nüchternheit vor der Probenentnahme",
"mapping": [ {
"map": "Specimen.collection.fastingStatusDuration",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Zeitliche Dauer der Nüchternheit vor der Probenentnahme"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess",
"type": [ {
"code": "BackboneElement"
} ],
"short": "Prozedur der Probenbearbeitung",
"mapping": [ {
"map": "Specimen.processing",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Prozedur der Probenbearbeitung"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess.Startzeitpunkt",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess.Startzeitpunkt",
"type": [ {
"code": "dateTime"
} ],
"short": "Zeitpunkt des Beginns der Probenbearbeitung",
"mapping": [ {
"map": "Specimen.processing.timePeriod.start",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Zeitpunkt des Beginns der Probenbearbeitung"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess.Endzeitpunkt",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess.Endzeitpunkt",
"type": [ {
"code": "dateTime"
} ],
"short": "Zeitpunkt des Abschlusses der Probenbearbeitung",
"mapping": [ {
"map": "Specimen.processing.timePeriod.end",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Zeitpunkt des Abschlusses der Probenbearbeitung"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess.Verarbeitungstyp",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess.Verarbeitungstyp",
"type": [ {
"code": "BackboneElement"
} ],
"short": "Prozedur der Probenbearbeitung",
"mapping": [ {
"map": "Specimen.processing.procedure",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Prozedur der Probenbearbeitung"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess.Temperatur",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess.Temperatur",
"type": [ {
"code": "Range"
} ],
"short": "Temperatur bei der die Probenverarbeitung stattfand. Angabe exakt oder in Wertebereichen (siehe SPREC)",
"mapping": [ {
"map": "Specimen.processing.extension[temperaturbedingungen]",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Temperatur bei der die Probenverarbeitung stattfand. Angabe exakt oder in Wertebereichen (siehe SPREC)"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess.Modus",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess.Modus",
"type": [ {
"code": "CodeableConcept"
} ],
"short": "Abhängig vom Verarbeitungstyp - bei Zentrifugation SPREC",
"mapping": [ {
"map": "Specimen.processing.procedure",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Abhängig vom Verarbeitungstyp - bei Zentrifugation SPREC"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess.VerwendungAdditive",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess.VerwendungAdditive",
"type": [ {
"code": "boolean"
} ],
"short": "Ja/Nein Angabe, ob ein Zusatzstoff verwendet wurde",
"mapping": [ {
"map": "Specimen.processing.additive",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Ja/Nein Angabe, ob ein Zusatzstoff verwendet wurde"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess.Additiv",
"max": "*",
"min": 0,
"path": "Biobank.Bioprobe.Verarbeitungsprozess.Additiv",
"type": [ {
"code": "CodeableConcept"
} ],
"short": "Additive bei der Probenbearbeitung wie Fixationsmittel; Einbettungs- und Eindeckungsmedien",
"mapping": [ {
"map": "Specimen.processing.additive",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Additive bei der Probenbearbeitung wie Fixationsmittel; Einbettungs- und Eindeckungsmedien"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Lagerprozess",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Bioprobe.Lagerprozess",
"type": [ {
"code": "BackboneElement"
} ],
"short": "Lagerung einer Probe",
"mapping": [ {
"map": "Specimen.processing[lagerprozess]",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Lagerung einer Probe"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Lagerprozess.Einlagerungszeitpunkt",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Bioprobe.Lagerprozess.Einlagerungszeitpunkt",
"type": [ {
"code": "dateTime"
} ],
"short": "Zeitpunkt des Beginns der Einlagerung der Probe",
"mapping": [ {
"map": "Specimen.processing[lagerprozess].timePeriod.start",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Zeitpunkt des Beginns der Einlagerung der Probe"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Lagerprozess.Auslagerungspunkt",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Bioprobe.Lagerprozess.Auslagerungspunkt",
"type": [ {
"code": "dateTime"
} ],
"short": "Zeitpunkt des Endes der Einlagerung der Probe",
"mapping": [ {
"map": "Specimen.processing[lagerprozess].timePeriod.end",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Zeitpunkt des Endes der Einlagerung der Probe"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Lagerprozess.Lagerungsbedingungen",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Bioprobe.Lagerprozess.Lagerungsbedingungen",
"type": [ {
"code": "Range"
} ],
"short": "Temperaturbereich in dem die Probe gelagert wurde bzw. wird. Angabe in Wertebereichen wie in SPREC",
"mapping": [ {
"map": "Specimen.processing[lagerprozess].extension[temperaturbedingungen]",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Temperaturbereich in dem die Probe gelagert wurde bzw. wird. Angabe in Wertebereichen wie in SPREC"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Laborbefund",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Bioprobe.Laborbefund",
"type": [ {
"code": "Reference"
} ],
"short": "Referenz auf den zu einer Probe gehörenden Laborbefund",
"definition": "Referenz auf den zu einer Probe gehörenden Laborbefund"
}, {
"id": "Biobank.Bioprobe.Pathologiebefund",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Bioprobe.Pathologiebefund",
"type": [ {
"code": "Reference"
} ],
"short": "Referenz auf den zu einer Probe gehörenden Pathologiebefund",
"definition": "Referenz auf den zu einer Probe gehörenden Pathologiebefund"
}, {
"id": "Biobank.Probensammlung-Biobank",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Probensammlung-Biobank",
"type": [ {
"code": "BackboneElement"
} ],
"short": "Organisation, die Proben verwaltet",
"mapping": [ {
"map": "Biobank",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Organisation, die Proben verwaltet"
}, {
"id": "Biobank.Probensammlung-Biobank.Kontakt",
"max": "*",
"min": 0,
"path": "Biobank.Probensammlung-Biobank.Kontakt",
"type": [ {
"code": "BackboneElement"
} ],
"short": "Kontaktinformationen einer Sammlung/Biobank für Anfragen zu Bioproben",
"mapping": [ {
"map": "Biobank.contact",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Kontaktinformationen einer Sammlung/Biobank für Anfragen zu Bioproben"
}, {
"id": "Biobank.Probensammlung-Biobank.Kontakt.Vorname",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Probensammlung-Biobank.Kontakt.Vorname",
"type": [ {
"code": "string"
} ],
"short": "Vorname der Ansprechperson",
"mapping": [ {
"map": "Biobank.contact.given",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Vorname der Ansprechperson"
}, {
"id": "Biobank.Probensammlung-Biobank.Kontakt.Nachname",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Probensammlung-Biobank.Kontakt.Nachname",
"type": [ {
"code": "string"
} ],
"short": "Nachname der Ansprechperson",
"mapping": [ {
"map": "Biobank.contact.family",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Nachname der Ansprechperson"
}, {
"id": "Biobank.Probensammlung-Biobank.Kontakt.E-Mail",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Probensammlung-Biobank.Kontakt.E-Mail",
"type": [ {
"code": "string"
} ],
"short": "E-Mailadresse für Anfragen",
"mapping": [ {
"map": "Biobank.contact.telecom[email]",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "E-Mailadresse für Anfragen"
}, {
"id": "Biobank.Probensammlung-Biobank.Kontakt.Rolle",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Probensammlung-Biobank.Kontakt.Rolle",
"type": [ {
"code": "CodeableConcept"
} ],
"short": "Rolle der Ansprechperson in der Sammlung/Biobank",
"mapping": [ {
"map": "Biobank.contact.extension[rolle]",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Rolle der Ansprechperson in der Sammlung/Biobank"
}, {
"id": "Biobank.Probensammlung-Biobank.Kontakt.Adresse",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Probensammlung-Biobank.Kontakt.Adresse",
"type": [ {
"code": "Address"
} ],
"short": "Kontaktadresse für Forschungsvorhaben",
"mapping": [ {
"map": "Biobank.contact.address",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Kontaktadresse für Forschungsvorhaben"
}, {
"id": "Biobank.Probensammlung-Biobank.Sammlungs-ID",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Probensammlung-Biobank.Sammlungs-ID",
"type": [ {
"code": "Identifier"
} ],
"short": "Interner Identifer der Sammlung/Biobank",
"mapping": [ {
"map": "Biobank.identifier",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Interner Identifer der Sammlung/Biobank"
}, {
"id": "Biobank.Probensammlung-Biobank.BBMRI-ERIC-ID",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Probensammlung-Biobank.BBMRI-ERIC-ID",
"type": [ {
"code": "Identifier"
} ],
"short": "Identifier der Sammlung/Biobank im BBMRI ERIC Netzwerk",
"mapping": [ {
"map": "Biobank.identifier[bbmri-eric-id]",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Identifier der Sammlung/Biobank im BBMRI ERIC Netzwerk"
}, {
"id": "Biobank.Probensammlung-Biobank.Akronym",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Probensammlung-Biobank.Akronym",
"type": [ {
"code": "string"
} ],
"short": "Akronym der Sammlung/Biobank",
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"map": "Biobank.alias",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Akronym der Sammlung/Biobank"
}, {
"id": "Biobank.Probensammlung-Biobank.Name",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Probensammlung-Biobank.Name",
"type": [ {
"code": "string"
} ],
"short": "Name der Sammlung/Biobank",
"mapping": [ {
"map": "Biobank.name",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Name der Sammlung/Biobank"
}, {
"id": "Biobank.Probensammlung-Biobank.Beschreibung",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Probensammlung-Biobank.Beschreibung",
"type": [ {
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} ],
"short": "Beschreibung der Sammlung/Biobank",
"mapping": [ {
"map": "Biobank.extension[beschreibung]",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Beschreibung der Sammlung/Biobank"
}, {
"id": "Biobank.Probensammlung-Biobank.Sammlungstyp",
"max": "1",
"min": 0,
"path": "Biobank.Probensammlung-Biobank.Sammlungstyp",
"type": [ {
"code": "CodeableConcept"
} ],
"short": "Typ der Sammlung/Biobank gemäß BBMRI ERIC Directory Werteliste",
"mapping": [ {
"map": "Biobank.type",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Typ der Sammlung/Biobank gemäß BBMRI ERIC Directory Werteliste"
}, {
"id": "Biobank.Probensammlung-Biobank.besteht-aus",
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"min": 0,
"path": "Biobank.Probensammlung-Biobank.besteht-aus",
"type": [ {
"code": "Reference"
} ],
"short": "Verknüpfung der Teilsammlungen",
"mapping": [ {
"map": "Biobank.partOf",
"identity": "FHIR"
} ],
"definition": "Verknüpfung der Teilsammlungen"
} ]
},
"baseDefinition": "http://hl7.org/fhir/StructureDefinition/Element"
}